O Conselho de Direcção da FLCS tem a seguinte composição: Director, Directores-Adjuntos, Directores de Centros Internos, Chefes de Departamento Académico, e Chefes de Departamento Técnico e Administrativo.
O Conselho de Direcção de Faculdade reúne-se, ordinariamente, duas vezes por semestre e, extraordinariamente, quando convocado pelo seu Presidente, ou a pedido de mais de metade dos seus membros.

Competências
Compete, especialmente, ao Conselho de Direcção, o seguinte:

1. Propor o plano de actividades da FLCS e o respectivo orçamento ao Conselho da Faculdade;
2. Apresentar relatórios anuais ao Conselho da FLCS;
3. Analisar o funcionamento dos departamentos e de outras unidades subordinadas; e
4. Preparar a agenda das reuniões do Conselho da FLCS.